- 新一代CRBN Binding Kit能否迎来TPD的另一个春天
- 点击次数：15 更新时间：2025-09-15
过去十年，靶向蛋白降解（TPD）从实验室宠儿跃升为千亿级产业，Cereblon（CRBN）作为较常用的 E3 酶之一，其配体亲和力数据直接决定 PROTAC 分子的活性窗口。然而，一个被忽视的技术细节——示踪剂（tracer）的标记方式——正悄悄拉大我们与真实客观数值的距离。
进口R品牌的高通量CRBN Binding Kit 用“沙利度胺-荧光蛋白"作为示踪剂，在行业内先建立了高通量筛选范式，这一方案如今被我们重新拆解、验证、升级。它不是简单的“国产替代"，而是对实验失真问题的系统性修复，让IC50更加接近客观真值。
失真源头：当 105 kDa 的 APC 蛋白骑在 0.25 kDa 的沙利度胺头上
XL665作为第一代acceptor，是改良过的别藻蓝蛋白（APC），将 APC的亚基偶联，增加了稳定性，位于红外光区，激发波长 620nm，发射波长665nm，进一步降低了生物溶液对实验的影响（生物学成分很少在红外光区有自发荧光），XL665作为acceptor在CRBN Binding中使用，分子量约为105 kDa，但是与沙利度胺偶联后，对体系有以下影响：
空间位阻：
✦ APC/XL665 的直径≈6nm，相当于沙利度胺长度的 10 倍，在 CRBN 浅口袋入口形成“荧光墙"；
✦ 大分子荧光标记会在 CRBN 浅口袋入口处产生空间位阻，导致表观 K_d 被系统性高估 1.5–4 倍。扩散速率：
✦ 蛋白示踪剂整体分子量高，扩散系数 D 下降 ；
✦ 小分子候选物（< 0.5 kDa）扩散系数远高于kit中标记后的沙利度胺，竞争环境失衡。结果失真：
✦ 以上这些影响因素导致IC50数值与结果存在偏差，影响候选物的选择
技术破局：把小分子还给小分子
用分子量小于1kDa的小分子荧光团直接标记沙利度胺，从物理层面消除两大失真因子，竞争动力学回到“小分子对小分子"的公平赛道，让每一次 IC50都经得起临床拷问。
数据说话
（1）标准曲线
由图表可知，由于Thalidomide标准品与Thalidomide-Ac竞争与CRBN/DDB1的结合，使信号值降低。
（2）结合活性和抑制剂验证*
Thalidomide-Ac与CRBN/DDB1结合验证，由结果可知，蛋白浓度不变时，检测信号随着Thalidomide-Ac浓度的升高而增加。Lenalidomide和Pomalidomide以及PROTAC BET Degrader-1可以竞争Thalidomide-Ac与CRBN/DDB1的结合。
*数据仅做示例参考
不止于 CRBN，更有 PROTAC的“一站式解决方案"
✦ 基于TR-FRET的三元复合物筛选
标曲 货号
商品名
abs560016
Human BRD4/CRBN PROTAC Binding Kit
abs560042
Human BCL-XL/CRBN PROTAC Binding Kit
abs560044
Human BCL-XL/VHL PROTAC Binding Kit
abs560012
Human DDB1-CRBN&GSPT1 Binding Kit
abs560054
HumanVAV1/CRBN PROTAC Binding Kit
✦ PROTAC药靶蛋白
靶点缩写
主要针对疾病
PROTAC
Absin
UA
AR（雄激素受体）
前列腺癌
ARV-110
UA080416
BCL6
淋巴瘤
UA080266
Bcl-X(L)
淋巴瘤
abs06285
B-rafV600E
恶性黑色素瘤
UA080261
BRD4
多种癌症
UA080277
BRD9
多种癌症
BTK
慢性淋巴细胞白血病
NX-2127
UA080041
EGFR
非小细胞肺癌
abs05321
ER（雌激素受体）
乳腺癌
ARV-471
abs04404
IRAK4
自身免疫性疾病
UA080294
KRASG12D
实体瘤
ASP-3082
UA010733
MDM2
多种癌症
MD-224
abs06561
NTRK
实体瘤
abs05487
STAT3
复发或难治性淋巴瘤
KT-333
UA080435
✦ PROTAC分子——阳性对照
货号
商品名
靶点
abs820796
(S,R,S)-AHPC hydrochloride
E3 ligase VHL
abs828204
ACBI1
SMARCA4:11 nM, SMARCA2:6 nM, PBRM1:32 nM
abs828800
AR Antagonist 1
Androgen Receptor:
abs825142
ARD-2128
VCaP:4 nM (IC50), LNCaP:5 μM (IC50)
abs821542
BETd-260
BRD4PROTAC
abs828404
BSJ-4-116
CDK12:6 nM
abs819411
dBET1
BRD4
abs826439
Dbet57
BRD4 (BD1):500 nM (DC50)
abs825346
dBRD9
ligand that recruits the cereblon E3 ubiquitin ligase:104 nM
abs821654
dTRIM24
TRIM24.
abs824454
LC-2
KRAS(G12C):0.25-0.76 μM (DC50)
abs819853
MD-224
MDM2
abs826178
MS4078
EML4-ALK:59 nM(DC50; NPM-ALK:11 nM(DC50);ALK:33 nM
abs828684
MT-802
BTK:1 nM(DC50)
abs821197
MZ 1
BRD4
abs821447
MZP-54
Brd4BD2
abs820470
PROTAC ERRα Ligand 1
IC50s of 0.04 and 2.8 μM for ERRα and ERRγ
abs828072
PROTAC ERRα Ligand 2
ERRα:5.67 nM
abs821731
TD-106
CRBN
abs823151
THAL-SNS-032
CDK9
abs826853
UNC6852
EED:247 nM
abs818009
VH-298
VHL:HIF-α
abs826121
YX-2-107
CDK6:4.4 nM
abs827426
ZEN-3219
BRD4BD1:0.48 μM, BRD4 BD2:0.16 μM
✦ PROTAC靶点相关抗体
靶点
货号
品名
Ubiquitin
abs155938
Mouse anti-Ubiquitin Monoclonal Antibody
AR
abs145396
Rabbit anti-Androgen Receptor mAb (JRMR-244)
BCL6
abs145233
Rabbit anti-BCL6 Monoclonal Antibody(JRMR-56)
Bcl-X(L)
abs159218
Rabbit anti-Bcl-XL Monoclonal Antibody(2D3)
B-rafV600E
abs173916
Rabbit anti-BRAF Recombinant mAb (S-1328-60)
BRD4
abs133244
Rabbit anti-Brd4 Polyclonal Antibody
BRD9
abs117685
Rabbit anti-BRD9 Polyclonal Antibody
More......
TPD 的黄金时代已经到来，但黄金也需要准确的刻度。我们相信，真实的数据是创新最大的加速器。当示踪剂的分子量回到小于1kDa，我们不仅修复了一个实验参数，更为整个行业节省了大量时间、资本与试错的生命。
好消息！Absin文献奖励重磅升级！
Absin产品线：爆款产品：试剂盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化检测、残留检测、多因子检测)；细胞培养(类器官试剂盒+基质胶，胎牛血清+培养添加剂+细胞因子)、分化试剂盒；分子(mRNA合成服务+提取试剂盒)；化合物大包装；辅助试剂、耗材/仪器、定制服务(抗体/多肽/蛋白/标记/检测)...
特色产品：鸡胚提取物CEE、B27、N2、霍乱毒素B亚单位CTB、牛脑垂体提取物BPE、百日咳毒素PTX、重组人胰岛素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...