- 类器官污染鉴别与除菌攻略(一)
- 点击次数:330 更新时间:2024-10-29
一、概述
类器官污染是一个老生常谈的事情,尤其是做胃肠道,组织本身带来的菌群数量非常庞大,一旦消毒不到位,就会导致类器官培养失败。类器官污染常见类型有细菌、真菌、支原体、黑胶虫等污染源,今天小爱带大家学习鉴别类器官污染及除菌方案。
二、类器官污染鉴别
1、细菌污染
细菌污染-肉眼下
污染特征:
● 肉眼下可明显观察基质内有明显黑色球体物;
● 而且呈多个黑色球状物分布;
● 生长迅速,通常D1就有会出现;
● 培养液隔夜即会变红黄浑浊。
细菌污染-镜下类器官原代提取D1
细菌污染特征:
● 细菌集落呈黑色团球状,wan全不透;
● 外围模糊,有朦胧感;
● 爆发非常快,一般1-2天即可出现大量集落。
细菌克星
货号
抗生素
作用对象
使用比例
储存条件
abs42020125
卡那霉素B硫酸盐
细菌(G+,G-)支原体
母液浓度10mg/mL(无菌水溶解),工作浓度稀释1:100
-20℃
abs42018967
硫酸庆大霉素溶液(10mg/mL)
细菌(G+,G-)支原体
稀释1:200
-20℃
abs9244
青链双抗
细菌(G+,G-)
稀释1:100
-20℃
abs9246
青霉素-链霉素-两性霉素B三抗
细菌(G+,G-)、真菌(如:酵母菌,霉菌)
稀释1:100
-20℃
abs9245
青霉素-链霉素-庆大霉素三抗
细菌(G+,G-)、支原体
稀释1:100
-20℃
2、真菌污染
左图 真菌污染特征——霉菌
右图 真菌污染特征——根霉
霉菌污染特征:
● 早期并不会使得培养基变黄变浑浊,但在显微镜下可观察到菌丝体;
● 真菌形成的菌丝呈丝状,管状,树枝状,串珠状。
真菌污染——酵母菌
小鼠胃类器官P0D1中发现的酵母菌团从左到右依次是4X、10X、20X
类器官基质胶中的酵母菌污染
类器官基质胶中的酵母菌+根霉污染
酵母菌污染特征:
● 酵母菌呈类似棉花絮状的团状物;
● 酵母菌等,当其行出芽生殖时可从一大一小的连体结构识别;
● 细胞被污染后,仍可生长,长时间类器官活力状态会变差;
● 梅雨季时的污染率会提高。
真菌克星
货号
抗生素
作用对象
使用比例
储存条件
abs42013298
两性霉素B
真菌(如:酵母菌,霉菌)
母液浓度2.5mg/mL(DMSO溶解),工作浓度稀释1:1000
-20℃
abs44071148
制霉菌素
真菌(如:酵母菌,霉菌)
母液浓度2mg/mL(DMSO溶解),工作浓度稀释1:100
-20℃
abs9246
青霉素-链霉素-两性霉素B混合溶液(100×三抗)
细菌(如G+,G-)、真菌(如:酵母菌,霉菌)
稀释1:100
-20℃
3、黑胶虫
黑胶虫污染特征:
● 活跃扭动;
● 多呈杆状;
● 培养基不浑浊。
黑胶虫清除剂PLUS (500×) abs9841
产品优势:
1)性能稳定:通过细菌、真菌、支原体、内毒素检测;通过渗透压、pH检测;通过产品性能检测;
2)高效快速:有效实现对“黑胶虫"的抑制和灭杀,减少不必要的实验损失;
3)环保安全:经上百种细胞验证无毒害作用。
使用方法:
1)请在收到货后, 将试剂管瞬时离心(3000rpm,3~5s)保存;
2)使用黑胶虫清除剂处理时, 建议现配现用, 并保持细胞密度在50%~60%;
3)推荐稀释比例为1:500。例如5mL培养基中加入10μL的黑胶虫清除剂。丢弃旧的培养基, 用PBS将细胞清洗干净, 再加入含有黑胶虫清除剂的新鲜培养基, 2天一次,连续处理一周。
黑胶虫预防剂(1000×)abs9842
产品优势:
1)高效稳定:通过产品性能检测,能够有效防治细胞培养中的“黑胶虫"污染问题;
2)环保安全:对细胞无毒性作用,在细胞培养过程中不会对细胞造成影响,本产品为多肽类,不像抗生素会影响细胞生长状态并让细胞产生耐药性。
使用方法:
1)使用黑胶虫预防剂(1000X)时, 建议现配现用;
2)推荐黑胶虫预防剂(1000X)的稀释比例为1:1000, 例如:10mL的培养基加入10μL的黑胶虫预防剂(1000X)。
4、支原体污染
支原体是实验室中常见的污染细胞的原核生物,污染主要来自组织、血清等动物性原材料和操作者本身。支原体直径在0.1-0.3μm,显微镜下也很难分辨,一般通过吸取培养液上清采用qPCR技术扩增DNA检测。
1)检测原理
TaqMan荧光探针是一种寡核苷酸探针,其5’末端携带荧光基团(报告基团),如FAM、CY5、VIC等,3’端携带淬灭基团,如TAMRA、BHQ1等。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一条特异性的荧光探针,探针完整时,荧光基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收。PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使荧光基团和淬灭基团分离,从而荧光监测系统(荧光定量PCR仪)可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成wan全同步。本试剂盒采用多重PCR的方法,用2种不同的荧光探针分别检测目标序列与内参。
2)清除试剂
支原体清除试剂Plus abs9253
产品优势:
● 特异性清除培养基中的支原体;
● 只需要3-6天,便可以有效清除支原体;
● 活性成分为抗生素,不会产生耐药性;
● 对细胞几乎无毒性,在100多种细胞上进行过验证,包括但不限于HEK293、Hela、MCF-7、MRC-5、NIH-3T3、CCC-ESF、CHO-S、CHO-K1、CHO-DG44、H295R、HL-60、K562、MDA-MB-231、SP2/0、T47D、BM和BV2等;
● 广谱性,可替代双抗,可以清除常见的革兰氏阴性和阳性菌;
● 可直接加入血清、培养基中,用于清除支原体污染。
3)使用方法
A、储存液的配制:
称取适量支原体清除试剂,配制成10mg/mL的储存液。适当分装后-20℃保存。如长时间不使用,也可以-80℃保存;
B、预防支原体污染或抑制支原体:
在细胞培养液中加入适量支原体清除试剂储存液,使最终浓度为0.01-0.5μg/mL,通常推荐使用的浓度为0.2μg/mL或0.5μg/mL。在添加了前述剂量的支原体清除试剂的情况下,可以有效防止支原体污染或抑制支原体增殖;
C、清除污染的支原体:
对于发现或怀疑有支原体污染的细胞,在细胞培养液中加入适量支原体清除试剂储存液,使最终浓度为0.5-250μg/mL。推荐依次尝试使用25、50、100和250μg/mL这4个浓度。在添加了前述剂量的支原体去除试剂的细胞培养液中培养1周后,检测是否还存在支原体污染。如果还是存在支原体污染,可以酌情提高支原体清除试剂的工作浓度。
5、非污染情况
因为类器官原代培养中,会有很多杂质、组织碎片、成纤维细胞等,容易造成细胞“污染"的假象,其实并非污染,如下所示:
1)成纤维细胞
成纤维细胞的胞体细长,又呈纤维样,很容易被误认为是菌丝体,被误判成真菌污染。其实仔细观察,成纤维细胞成梭形,胞体中间粗,两头细长,而菌丝体整体粗细均匀。
左图 基质胶底层贴壁生长的成纤维细胞
右图 真菌污染特征——霉菌
2)组织碎片
在提取原代细胞的过程中,在组织解离过程中产生很多细胞碎片及杂质,故原代培养背景会比较脏,这种情况也容易被误认为污染。接下来,小爱带大家了解一下组织碎片特点:
● 原代组织碎片往往成不规则形状,区别于菌团椭圆形菌落形态;
● 原代组织杂质往往大小不一,形态各异;菌团形态均一,均为椭圆状。
今天讲解就到这了,大家如有实验问题,欢迎一起交流哦!
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货号
品名
规格
货期
abs9841
黑胶虫清除剂PLUS(500×)
400uL×5
现货
abs9842
黑胶虫预防剂(1000×)
500uL×5
现货
abs9925
支原体检测试剂盒(qPCR法)
50T
1-2周
abs9253
支原体清除试剂Plus
20mg/100mg
1-2周
abs42020125
卡那霉素B硫酸盐
250mg
现货
abs42018967
硫酸庆大霉素溶液(10mg/mL)
10mL
现货
abs9244
青链双抗
100mL
现货
abs9246
青霉素-链霉素-两性霉素B三抗
100mL
现货
abs9245
青霉素-链霉素-庆大霉素三抗
100mL
现货
abs42013298
两性霉素B
1g/5g
现货
abs44071148
制霉菌素
1g/5g
现货
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