- Western Blot进阶技巧首弹——从了解目的蛋白开始
- 点击次数:4567 更新时间:2020-05-26
蛋白质印迹 (Western Blot),相信大家对此都不陌生,做为检测蛋白表达及半定量的基础实验方法,也是很多小伙伴们初入实验室的入门课。
“上手容易,精通难”可谓对WB实验的注释,初入实验室的“菜鸟”可以很快上手,做出漂亮的条带,做过多年的“大神”也可能一着不慎,实验“翻车”,结果一塌糊涂。有些实验室甚至流传着一些所谓的“玄学”,新手人品好,难做的条带给新手做等等。
真的是这样么?实验技术可不是拼人品,靠运气的事儿,接下来小编将会为大家带来WB进阶技巧系列,干货满满,让大家提升WB实验技巧,成为真正的实验“大神”。
首先,让我们了解一下什么是WB实验吧:▲《定义》WB又称为免疫印迹 (immune blot) ,是根据抗原抗体的特异性结合半定量的检测样品中的某种蛋白的方法。
▲《原理》通过凝胶电泳,将不同分子量大小的蛋白质分离开,再利用特异性抗体对凝胶电泳处理过的细胞或生物组织样品进行着色。通过分析着色的位置和着色深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中表达情况的信息。
▲《应用》定性检测:目标蛋白有无,分子量大小;定量检测:检测目标蛋白含量(半定量)
图1. WB操作流程图
看到这,相信之前对WB了解不多的同学也应该对WB有了一个基础的认识。那么,怎样可以把这看似简单的几步做好,拿到漂亮的实验结果呢?话不多说,上干货。
小编首先要强调的一点,就是了解目的蛋白,这也是今天这篇文章主要给大家分享的内容。可能有的小伙伴会有疑问,为什么要讲一个跟WB操作没关系的步骤呢?说好的WB进阶呢?其实,这往往是很多新手忽视的关键点,对目的蛋白一知半解,是没有办法做好WB实验的,其他免疫学实验也是一样,可能有的小伙伴还不是特别相信,接下来让小编带大家看看为什么了解目的蛋白是如此的重要吧~
了解目的蛋白对整个WB实验的重要性:
1. 了解目的蛋白,才知道目的蛋白在实验样品中是否有表达WB实验检测,很多小伙伴会遇到的问题之一就是无条带,也就是阴性结果,如何判断阴性结果是实验操作问题造成的“假阴性”还是本该如此的“真阴性”,这就需要大家在实验前,就对目的蛋白有一个清晰的认识。很多蛋白的表达是有组织特异性的,例如IL-10R,在视网膜,脾脏和肺腺癌组织中有高表达,其他组织表达含量较低;还有一些蛋白,则需要特定的刺激条件才会高表达,这种情况往往在磷酸化蛋白及炎症因子蛋白等中较为常见,如果未做特殊的处理,目的蛋白表达含量很低,无法被WB检测出。
2.了解目的蛋白,才知道如何制备样本样本制备也是WB的关键步骤,后续的文章中也会为大家详细分析。如何选择合适的样本制备方法,关键因素就是要了解目的蛋白;除了上面一步中的要了解目的蛋白表达组织,及预处理条件外,还需确认目的蛋白表达的亚细胞定位,例如,细胞膜蛋白,核蛋白,线粒体蛋白和胞浆蛋白的提取方式都不一样,选择合适的方式,才能制备合格的样品,方便后续的WB实验。另外一个需要注意的因素就是需要加入对应的蛋白酶抑制剂,这一点对于磷酸化的蛋白尤为重要,否则蛋白在提取过程中就被降解,会造成“假阴性”结果。
图2. 裂解液选择参考表3. 了解目的蛋白,才知道如何选择内参
内参抗体,是WB实验中的重要参考,WB可以对目的蛋白进行半定量分析,判断不同样品中目的蛋白表达含量的多少,就是取决于内参的标定。内参选择在WB实验中是很关键的因素,可不是GAPDH或者β-actin万用的哦。内参如何选择,重要的决定因素就是目的蛋白,尤其是目的蛋白的表达位置及预处理条件。小编在这里总结了一下内参的选择表,大家可以保存哦~
图3. 内参选择参考表
好了,相信大家应该知道实验前了解目的蛋白的重要性了吧,如何了解目的蛋白呢?可以通过UniProt网站搜寻蛋白的相关信息,也可以在Pubmed上查阅对应的研究文献,相信聪明的小伙伴们肯定可以做好的,今天的分享就先到这,接下来我们还会分享整个WB操作过程中的细节,全面提升大家的WB水平,欢迎关注!
蛋白质印迹(Western Blot)实验中产品推荐:
实验步骤 推荐指数 货号 产品名称 规格 样本制备 abs9228 RIPA (中) 100ml abs9229 RIPA (强) 100ml abs9230 RIPA (弱) 100ml abs9231 RIPA (强,无抑制剂) 100ml abs9160 NP-40 100ml abs9195 1M Tris-HCl,pH6.8 1L abs9201 1M Tris-HCl,pH8.8(更多pH请看absin网站) 1L abs9117 SDS 100ml ★★ abs9116 WB/IP 细胞裂解液 100ml ★★ abs9239 WB/IP 细胞裂解液(无抑制剂) 100ml ★★★★ abs9101 红细胞裂解液 100ml,250ml,500ml abs812852 PMSF 50mg,100mg,200mg abs816442 Aprotinin 抑肽酶 10mg,25mg,50mg,100mg abs817902 Peptatin 胃蛋白酶抑制剂A 10mg,25mg,50mg,100mg abs9133 EDTA 100ml abs42017684 EGTA 1g,10g abs817431 原钒酸盐 100mg,500mg abs47014865 β-甘油磷酸盐 10g,25g ★★ abs9161 广谱型蛋白酶抑制剂混合物 1ml ★★ abs9162 广谱型磷酸酶抑制剂混合物 1ml 蛋白定量 ★★ abs9232 BCA蛋白定量试剂盒 500次,2500次 ★★ abs9233 增强型BCA 蛋白定量试剂盒 500次 上样与电泳 abs9226 DTT溶液(1mol/L) 5ml,10ml abs9237 2X Laemmli样品缓冲液 5ml*2 abs9238 10%SDS十二烷基硫酸钠溶液 500ml ★★ abs953 2*上样缓冲液 (适用于SDS-PAGE) 10ml ★★ abs9301 预制胶 10%,10 wells 5片/盒 ★★ abs9308 预制胶 10%,15 wells 5片/盒 ★★ abs9302 预制胶 12%,10 wells 5片/盒 ★★ abs9309 预制胶 12%,15 wells 5片/盒 abs9303 预制胶 15% ,10 wells 5片/盒 abs9310 预制胶 15% ,15 wells 5片/盒 abs9304 预制胶 4-15%, 10 wells 5片/盒 abs9311 预制胶 4-15%, 15 wells 5片/盒 ★★ abs9305 预制胶 4-20%, 10 wells 5片/盒 ★★ abs9312 预制胶 4-20%, 15 wells 5片/盒 abs9307 预制胶 8%, 15 wells 5片/盒 abs9306 预制胶 8-20%, 10 wells 5片/盒 abs9313 预制胶 8-20%, 15 wells 5片/盒 NEW abs9328 3-5kd小分子量预制胶,16.5%,10wells 10片/盒 NEW abs9329 3-5kd小分子量预制胶,16.5%,15wells 10片/盒 ★★★ abs925 蛋白电泳套装 盒 abs951 running buffer 100ml,1L ★★★★★ abs923 预染蛋白marker, 10-245 KDa 500ul,5*500ul ★★★★★ abs924 预染蛋白marker, 10-180 kDa 250ul,2*250ul abs966 Genshare考马斯亮蓝蛋白胶快速染色液 500ml ★★★ abs964 考马斯亮蓝染色试剂盒(常规型)R250 1kit abs965 考马斯亮蓝染色试剂盒(增强型)G250 1kit 转膜 abs931 PVDF膜0.2 μm 20张 ★★ abs932 PVDF膜0.45 μm 20张 ★★ abs959 NC膜0.2 μm 20张 abs960 NC膜0.45 μm 20张 abs950 10*电转液 100ml,1L 封闭 abs9174 脱脂奶粉 100g,500g ★★★★★ abs9155 BSA 50g,100g 一抗孵育 ★★ abs830031 Beta actin antibody 50ul,100ul abs132001 Beta actin antibody 50ug,100ug abs119680 Beta Actin Polyclonal Antibody 50ul,100ul abs132184 Beta-Actin antibody 50ug,100ug abs137975 Beta-Actin Mouse Monoclonal Antibody 50ug,100ug ★★ abs830030 GAPDH antibody 50ul,100ul abs132004 GAPDH antibody 50ug,100ug abs137959 GAPDH Mouse Monoclonal Antibody 50ug,100ug abs118936 GAPDH Polyclonal Antibody 50ul,100ul abs131993 Tubulin alpha Antibody 50ug,100ug ★★ abs830032 Tubulin Beta antibody 50ul,100ul abs131994 Tubulin beta Antibody 50ug,100ug abs125209 Tubulin Beta Polyclonal Antibody 50ul,100ul 二抗孵育 ★★ abs928 Goat anti-mouse IgG-HRP 100ul,500ul,1ml ★★ abs20002 Goat anti-rabbit IgG-HRP 100ul,500ul,1ml ★★ abs20003 Goat anti-Mouse IgG-FITC 1ml,500ul,100ul ★★ abs20004 Goat anti-Rabbit IgG-FITC 100ul,500ul,1ml ★★ abs20005 Rabbit anti-Goat IgG-HRP 100ul,500ul,1ml 一抗孵育 abs830001 Anti- GST 50ul,100ul abs830002 Anti- His Tag抗体 50ul,100ul abs830003 Anti- His(C-terminal Specific) 抗体 50ul,100ul abs830004 Anti- Myc 抗体 50ul,100ul abs830005 Anti- DYKDDDDK 50ul,100ul abs830006 Anti- HA 抗体 50ul,100ul abs830008 Anti-V5,mAb 50ul,100ul abs830010 Anti- GST,HRP 50ul abs830011 Anti- His Tag (HRP) 抗体 50ul abs830012 Anti- His(C-terminal Specific) (HRP) 抗体 50ul abs830013 Anti- Myc (HRP) 抗体 50ul abs830014 Anti- DYKDDDDK,HRP 50ul abs830015 Anti- HA (HRP) 抗体 50ul abs830016 Anti- V5 (HRP) 抗体 50ul abs137956 C-Myc-Tag Mouse Monoclonal Antibody 50ug,100ug abs137958 Flag-Tag Mouse Monoclonal Antibody 50ug,100ug 显色 ★★★★★ abs920 ECL化学发光检测试剂盒 2*25ml,2*50ml,2*250ml abs9212 DAB 显色试剂盒(棕黄色,WB) 1kit abs9213 DAB 显色试剂盒(紫蓝色,WB) 1kit 其他辅助试剂 abs952 10*TBST 100ml,1L abs9152 Tween-20 500ml ★★ abs954 WB一抗二抗稀释液 100ml abs969 Western一抗二抗去除液(中性) 250ml abs968 Western一抗二抗去除液(弱碱性) 250ml abs967 Western一抗二抗去除液(强碱性) 250ml 新手* ★★★★★ abs926 WB solution base kit(rabbit) 1kit ★★★★★ abs927 WB solution base kit(mouse) 1kit ★★★★★ abs928 WB solution base kit(goat) 1kit
WB相关:ECL发光液、预染marker、预制胶;IHC相关:二抗试剂盒、组化笔;IP/CoIP试剂盒;激动剂/抑制剂;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡试剂盒;呼吸爆发试剂盒;ELISA试剂盒;重组蛋白;抗体: 二抗、标签抗体、对照抗体;定制服务(抗体/多肽/蛋白/标记/检测)...